葡萄牙专利法为专利申请人提供了两种专利申请的方式，即临时专利申请(PPA)和非临时专利申请(PA)。
PA必须用葡萄牙语提交，并且必须满足标准专利申请的正式要求，申请费为109.07欧元。葡萄牙专利局(INPI)在提交PA后的10个月内将出具一份检索报告和一份关于专利可专利性的书面意见。此举的好处是，如果专利申请缺乏新创性，申请人就可以在向海外正式递交专利申请之前，按检索报告及书面意见进行相应的修改。
对于希望确保其发明尽快获得申请日的申请人来说，临时申请则非常有用。
PPA可以葡萄牙语或英语提交。如果申请人打算在PPA提交之日起12个月内提交国际专利申请，或在同一期间内，向以英语为官方语言的国家提交相应的专利申请，如向美国专利商标局(USPTO)或欧洲专利局(EPO)提出申请，申请人可以节省出从葡萄牙语翻译成英语的费用。
申请PPA的官方费用相对较低，仅需65.45欧元，PPA将成为创建专利家族的首次申请，即优先权。相比之下，在欧洲专利局提交首次专利申请的官方费用通常从1470欧元起。
值得一提的是，若要提交PCT国际专利申请或直接在EPO提交专利申请，则无需在葡萄牙将PPA转换为PA。换句话说，PPA可以被随时放弃而失效，而且如果PPA是用英语提交的，就没有必要花钱将其从英语翻译成葡萄牙语。
PPA在葡萄牙的另一个优势是，向INPI递交的申请文件中甚至不需要包括权利要求。此外，还可以提交彩色说明书附图或手绘的说明书附图。
在收到申请人提出的临时申请后，INPI将在收到临时申请的10个月内出具一份检索报告。该检索报告类似于PCT申请的国际检索报告，明确列出可能影响新颖性/创造性的现有技术文件。
临时申请PPA必须在提交后12个月内将临时申请转换为正式申请PA。
根据葡萄牙专利法，在由临时申请PPA转换为正式申请PA时，不允许添加新主题(new matter)。
在由PPA转换为PA时，如申请人添加了新主题，则INPI将通知申请人必须删除，否则将无法从临时申请转换为正式申请。此外，根据葡萄牙专利法的规定，葡萄牙专利申请不能要求其他葡萄牙专利申请为优先权。换句话说，葡萄牙专利法中没有国内优先权的概念。
因此，申请人应在提出临时申请PPA时就包含所有完整信息。在由PPA转换为PA时不允许增加新主题，这被认为是目前葡萄牙专利法的不足之处。
INPI将审核PPA转换为PA时是否有添加新主题，添加新主题将使新申请获得新的申请日。
如：一种用于治疗特定疾病的药物组合物，其中所述组合物包括作为活性原理的特定分子活性物质(API 1)和特定辅料(E)，其中后者促进了API 1在生物体的目标组织中的意外生物利用度。
在提交临时申请PPA后，发明人继续进行进一步的实验测试，并得出结论，该发明可与另一种与API密切相关的化学物质(API 2)正常工作。随后，在由临时申请时转换为正式申请时，发明人提出以下权利要求:
一种以包含API 1和E为特征的药物组合物。
一种药物组合物，其特征是含有API 2和E。
这种情况下，INPI会认为权利要求2的主题与一个新主题有关，并会通知申请人将其从权利要求中删除。申请人必须删除新添加的实施例，以避免无法转换为正式申请。此外，申请人还必须提交涉及第二个实施例的正式申请。
考虑到正式申请的费用，这种情况会增加申请人的成本。
另一方面，如果临时申请PPA只有权利要求书1的主题，并且申请人在12个月内提交了包含权利要求书1和权利要求书2的PCT国际申请，作为国际检索单位的EPO将会检索到权利要求书2是一个新主题，但并不会因此拒绝PCT申请。
相反，EPO会认为权利要求2有一个不同的优先日期，即PCT国际申请日，实质性审查将在此基础上进行。
随后，PCT申请可以进入葡萄牙国家阶段，并表示如果权利要求1和2被认为是新颖和创造性的，国家专利申请将被批准。
或者，PCT申请可以进入欧洲阶段，在欧洲专利获得批准后，进而在葡萄牙生效。因此，考虑到起诉只发生在葡萄牙或国外，禁止在葡萄牙临时申请PPA中添加新主题可能会导致申请人产生矛盾的结果。
无论是临时申请PPA或正式申请PA，两者官方费用都比较低，并可在申请日12个月内获得检索报告和可专利性报告。对于希望在国外提交相应专利申请的申请人来说，在葡萄牙提交首次申请是非常有性价比的办法。